Para la agroindustria, la calidad y seguridad final de los productos o alimentos manejados, depende de la higiene y desinfección adecuadas de sus equipos, utensilios e instalaciones. El plan de limpieza debe realizarse a la medida de cada industria, estableciendo las características de dichas instalaciones y equipos, además del tipo de residuos y de contaminación que se genera como consecuencia de los procesos. El plan de limpieza e higiene debe garantizar que los equipos y los utensilios de trabajo estén limpios en el inicio del trabajo, de ser necesario, durante su uso, y al finalizar la producción.
